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3.747分生信分析:LINC02147低表达促进口腔黏膜下纤维化恶性进展
来源: | 作者:生信博士 | 发布时间: 2022-09-17 | 643 次浏览 | 分享到:

题目:Low LINC02147 expression promotes the malignant progression of oral submucous fibrosis

杂志:BMC Oral Health

日期:2022年7月29日

Doi: 10.1186/s12903-022-02346-4

 

背景:确定了与口腔黏膜下纤维化 (OSF) 向口腔鳞状细胞癌 (OSCC) 恶性进展相关的关键 lncRNA。

 

方法:基于 GEO 数据库,确定从正常口腔黏膜(NOM)到 OSF 再到 OSCC 的顺序变化的关键 lncRNA。 Kaplan-Meier 分析用于筛选与 OSCC 预后相关的 lncRNA。 Cox回归分析用于验证独立预后价值。 qPCR 用于确认候选 lncRNA 的表达。进行基因集富集分析(GSEA)、核质分离测定、荧光原位杂交、RNA敲低、蛋白质印迹和细胞活力测定以研究候选lncRNA的生物学功能。构建列线图以基于 TCGA 定量预测 OSCC 预后。

 

结果:生物信息学方法表明 LINC02147 从 NOM 到 OSF 再到 OSCC 依次下调,临床组织和细胞证实了这一点。同时,LINC02147 的低表达作为一个独立的预后因素,预示着 OSCC 的预后不良。 GSEA 和体外研究表明 LINC02147 的低表达通过促进细胞增殖和分化来促进 OSF 恶性进展。基于 LINC02147 签名的列线图成功量化了每个指标对 OSCC 总体生存的贡献。

 

结论:LINC02147 低表达促进 OSF 恶性进展并预测 OSCC 预后不良。