题目：A cholesterogenic gene signature for predicting the prognosis of young breast cancer patients

杂志：PeerJ

日期：2022年8月18日

Doi: 10.7717/peerj.13922

目的：旨在建立一个胆固醇基因特征来预测年轻乳腺癌 (BC) 患者的预后，然后使用细胞系实验对其进行验证。

方法：在生物信息学部分，从TCGA数据库下载年轻 BC 患者的转录数据和相应的临床数据作为训练集。在肿瘤组织 (n = 183) 和正常组织 (n = 30) 之间比较差异表达基因 (DEG)。通过使用单变量 Cox 回归和多 COX 回归，建立了一个五胆固醇基因特征来预测预后。对来自GEO的 GSE131769 进行亚组分析和外部验证以验证基因特征。随后，在实验部分，进行了细胞实验，以进一步验证 BC 中 5 个促胆固醇基因的生物学作用。

结果：在生信分析部分，共筛选出97个上调基因和124个下调胆固醇基因作为TCGA中的DEG用于训练模型。建立了包含 5 个胆固醇生成基因的风险评分特征，可以区分年轻 BC 患者在高危和高危之间的预后。在 TCGA 数据集中，具有 AUC 的螯合基因特征的预测值为 0.810。然后在 GSE131769 中验证预测值。在实验部分，虽然CD24、GRAMD1C和ACSS2的下调对细胞活力没有显着影响，但NFKBIA下调促进了BC细胞的活力、集落形成能力和侵袭能力，而INHBA下调则具有相反的作用。

结论：五胆固醇基因特征在预测年轻 BC 患者预后方面具有独立的预后价值和稳健的可靠性。细胞实验结果表明，NFKBIA在乳腺癌中起保护作用，而INHBA在乳腺癌中起促癌作用。